適用製品
配列抽出システム、配列抽出方法、及び配列抽出プログラム
目的
立体構造解析に適したタンパク質のアミノ酸配列を簡易に抽出することが可能な配列抽出システム、配列抽出方法、及び配列抽出プログラムを提供する。
効果
立体構造解析に適したタンパク質のアミノ酸配列を簡易に抽出することが可能な配列抽出システム、配列抽出方法、及び配列抽出プログラムを提供することができる。
技術概要
ターゲットタンパク質のターゲットアミノ酸配列の全部又は一部に少なくとも1つの挿入ポリペプチドの挿入アミノ酸配列を挿入する挿入パターンの複数の候補である、複数の候補挿入パターンのそれぞれに基づいて、前記ターゲットアミノ酸配列の全部又は一部に前記挿入アミノ酸配列を挿入した融合配列の複数の候補である、複数の候補融合配列を生成する候補配列生成部と、
前記複数の候補融合配列のそれぞれに基づいて、前記複数の候補融合配列のそれぞれに対応する複数の候補融合タンパク質のそれぞれの構造の予測の結果を示す構造予測結果情報を取得する構造予測結果取得部と、
前記予測の結果に基づいて、前記挿入アミノ酸配列を挿入した挿入箇所を評価する評価部と、
前記評価の結果に基づいて、前記複数の候補融合配列のうち少なくとも1つの候補融合配列を抽出する配列抽出部と、
と備える配列抽出システム。