効果
リファレンス配列との比較を行う必要なく、次世代シーケンサーの配列解析のみから、新規の活性のある転移因子の転移を検出できる。配列自体も分からなかった新規の転移因子の新たな転移を正確に捉えることが可能である。
技術概要
配列中の転移因子を特定する方法であって、
(A)2種類のサンプル由来のショートリードから、X塩基の配列を1塩基ずつずらして切り出す工程と、
(B)得られた複数のX塩基の各配列の頻度を取得する工程と、
(C)得られた複数のX塩基の配列において、ぞれぞれの配列の前半部分および後半部分のリファレンス配列上での位置を取得して比較する工程と、
を含む、方法。