適用製品
哺乳動物細胞におけるＲＮＡ中のウリジンまたはシチジンの５位の転写後修飾部位を同定する方法、転写後修飾部位と、疾患の関連性を決定する方法、並びに、対象が、疾患に罹患している可能性、または、疾患を発症する可能性を検査する方法
目的
哺乳動物細胞におけるＲＮＡ中のウリジンまたはシチジンの５位の転写後修飾部位を同定する方法、ウリジンモノリン酸またはシチジンモノリン酸のの新合成機能を欠失した、または、阻害した哺乳動物細胞。ＲＮＡ中のウリジンの５位の転写後修飾部位と、疾患の関連性を決定する方法、並びに、対象が、疾患に罹患している可能性、または、疾患を発症する可能性を検査する方法、を提供する。
効果
ウリジンモノリン酸またはシチジンモノリン酸の新合成機能を欠失した、または、阻害した哺乳動物細胞を利用することにより、ＲＮＡ中のウリジンまたはシチジンの５位の転写後修飾の部位および種類を、正確に特定することを可能にした。さらに、安定同位体標識したＲＮＡを内部標準として用いる定量ＲＮＡ分析方法を組み合わせることにより、転写後修飾のランドスケープの作成を可能にした。疾患の関連する転写後修飾の同定、さらに、対象が、疾患に罹患している可能性、または、疾患を発症する可能性を検査することも可能になる。
技術概要
ＲＮＡ中のウリジンまたはシチジンの５位の転写後修飾部位を同定する方法であって、
（１）ウリジンモノリン酸またはシチジンモノリン酸の新合成機能を欠失した、または、阻害した哺乳動物細胞を、５位を標識したウリジンまたはシチジンを含む培地で培養し、
（２）（１）で得られた培養細胞から、目的のＲＮＡを取得し、
（３）目的ＲＮＡの質量分析を行い、そして、
（４）（３）の質量分析スペクトルを、ＲＮＡ中のウリジンまたはシチジンの５位の転写後修飾部位が全く生じない場合の質量分析スペクトルと比較することにより、目的ＲＮＡ中のウリジンまたはシチジンの５位の転写後修飾部位を同定する、
ことを含む、前記方法。
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