適用製品
配列情報、とりわけ、ゲノム等の生体分子の配列情報の情報処理の分野
目的
２つ以上の配列の間における多型を検出する方法が提供される。
効果
２つ以上の配列の間で、全長配列における位置を考慮する必要なく、正確に多型、特に置換を検出することができる。
技術概要
対象配列データにおいてコントロール配列データに対する多型を検出する方法であって、
ａ）該対象配列データの長さｋの部分配列のサブセットの各々の部分配列の出現頻度を提供する工程と、
ｂ）該コントロール配列データの長さｋの部分配列のサブセットの各々の部分配列の出現頻度を提供する工程と、
ｃ）対象配列とコントロール配列とを比較し、該出現頻度の分布の比較に基づいて、多型を検出する工程と
を包含し、ここで、ｋは該対象配列および該コントロール配列のいずれか短いほうの全長以下の整数である、方法。
基本情報
開放特許情報
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登録者情報
その他の情報
