適用製品
ＤＮＡマイクロアレイ、ブーリアンネットワーク、転写因子
目的
ＤＮＡマイクロアレイを用いながらも、高精度に遺伝子相互作用の推定を行うことができる遺伝子相互作用推定方法、遺伝子相互作用推定プログラム、及び遺伝子相互作用推定装置、並びに、これら遺伝子相互作用推定方法、遺伝子相互作用推定プログラム、及び遺伝子相互作用推定装置に用いて好適な結合サイト推定方法、結合サイト推定プログラム、及び結合サイト推定装置の提供。
効果
本技術によれば、ＤＮＡマイクロアレイデータの影響及び結合パターンに含まれるあいまいさの影響を低減することができ、ＤＮＡマイクロアレイを用いながらも、高精度に遺伝子相互作用及び結合サイトの推定を行うことができる。
技術概要
この技術では、ＤＮＡマイクロアレイ破壊株データ、ＤＮＡ塩基配列データ、及び相互作用の推定対象となる遺伝子ａのデータが遺伝子相互作用推定装置に入力される。なお、ＤＮＡマイクロアレイデータとは、ＤＮＡマイクロアレイ技術によって得られた遺伝子ａの発現データであり、ＤＮＡマイクロアレイ破壊株データとは、ＤＮＡマイクロアレイデータの１種であり、破壊株と野生株との発現量の比を観測したデータである。ここで、破壊株とは、実験的手法によって標的となる遺伝子ａを破壊した株のことであり、野生株とは、遺伝子ａを破壊していない株のことである。また、株とは、遺伝的形質が同じ生物の別の個体である。さらに、ＤＮＡは、４つの塩基文字（ａ，ｔ，ｇ，ｃ）から構成される１つの塩基配列とその相補配列とが互いに結合し、二重らせん構造をとっている物質であるが、ＤＮＡ塩基配列データとは、かかる配列の片側の塩基配列を表したデータである。
基本情報
開放特許情報
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登録者情報
その他の情報
