目的
大規模な発現プロファイルデータベースから共発現モジュールを網羅的に探索できるモジュール探索技術の提供を目的とする。 また、生物学的に意味のある共発現モジュールをより高い精度で探索できるモジュール探索技術の提供を目的とする。
効果
大規模データベースから共発現モジュールを網羅的に探索できるモジュール探索技術を提供することができる。 また、生物学的に意味のある共発現モジュールをより高い精度で探索できるモジュール探索技術を提供することができる。
技術概要
遺伝子発現モジュール探索装置は、遺伝子セットの発現値を有する発現プロファイルのデータベースから、遺伝子サブセットと発現プロファイルサブセットで構成されており、共通する発現パタンが現れる共発現モジュールを探索する。 離散発現プロファイルデータベースは、多数の発現プロファイルから生成された多数の離散発現プロファイルを有する。 離散発現プロファイルでは、発現値が離散化されて離散ラベルに変換されている。 モジュール探索部は、クエリプロファイルとデータベースから離散値行列を生成し、離散値行列をクエリプロファイルに基づいて圧縮する。 圧縮後の行列が、飽和アイテム集合列挙法を用いたバイクラスタリングにより処理され、共発現モジュールが求められる。 さらに、許容ノイズ以下の範囲でノイズを許容して、複数の共発現モジュールを融合する。
基本情報
開放特許情報
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登録者情報
その他の情報
