適用製品
ＤＮＡ試料中の目的塩基がシトシンであるかメチルシトシンであるかを判定するメチルシトシン検出方法、プローブ、キット、核酸チップ、エピジェネティクス、シトシンのメチル化、癌の発生、再発、転移のマーカー
目的
ＤＮＡ試料中の目的塩基がシトシンであるかメチルシトシンであるかを判定できる簡便な方法、及びそれに用いるプローブ、キット、核酸チップ、及びメチルシトシン検出装置の提供。
効果
第２工程において目的塩基を含むハイブリダイズ産物を酸化剤で処理し、目的塩基がメチルシトシンである場合は、メチル基を有する炭素原子を酸化する。メチルシトシンとしては５−メチルシトシンが代表的である。５−メチルシトシンは、シトシンに比べて、ピリミジン環の５位炭素原子が酸化され易いため、酸化処理物を比較して、酸化反応物の有無を検出することにより両者を識別できる。
技術概要
この技術は、目的塩基を有するヌクレオチドを除きそれに隣接する両側の領域と相補的なガイドプローブ（バルジ形成プローブ）とＤＮＡ試料とをハイブリダイズさせれば、目的塩基を有するヌクレオチドのみ二重らせんから外部に飛び出したバルジ構造を形成し、ＤＮＡ試料中のその他のヌクレオチドは二重らせん構造中に埋没するため、目的塩基にのみ反応を引き起こすことができることに基づく。すなわち、ＤＮＡ試料中のシトシンのメチル化を検出する方法であって、目的とするシトシン又はメチルシトシンがバルジ構造又はミスマッチを形成するようＤＮＡ試料とガイドプローブとをハイブリダイズさせる第１工程と、バルジ構造又はミスマッチを形成するシトシン又はメチルシトシンに特異的な反応を誘導し、この反応の有無によりメチル化を検出する第２工程とを含むメチルシトシン検出方法とする。
基本情報
開放特許情報
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登録者情報
その他の情報
